Antigène rotavirus
Examen biologique : Virologie et infections virales. L’antigène rotavirus est une recherche qualitative de rotavirus dans les selles, habituellement réalisée par immunoessai; le code LOINC 5880-0 décrit une présence d’antigène sur selles par immunoessai et un résultat ordinal. Elle est utilisée lorsque la confirmation de rotavirus est utile chez une personne présentant une gastro-entérite aiguë, car les signes cliniques ne distinguent pas de façon fiable le rotavirus des autres agents entériques. Le résultat attendu est une catégorie présence/détection ou absence/non-détection; un résultat négatif n’exclut pas totalement l’infection si la charge virale est faible ou si le prélèvement est inadéquat.
À quoi sert cet examen
La confirmation de rotavirus ne peut pas reposer uniquement sur la présentation clinique, car la gastro-entérite à rotavirus ressemble à celles dues à d’autres agents; un test de laboratoire est nécessaire pour une confirmation fiable [s3,s4,s7].
Le CDC décrit, sur prélèvement de selles, les immunoessais de détection antigénique comme une méthode de détection rapide du rotavirus, au même titre que les tests d’acides nucléiques [s2].
L’OMS définit comme cas confirmé de surveillance un cas suspect dont les selles montrent la présence de rotavirus par immunoessai enzymatique ou méthode fondée sur la PCR [s1].
L’immunoessai antigénique convient à la routine et à la surveillance; la PCR et le séquençage sont surtout utilisés pour des investigations, la caractérisation des souches ou la recherche [s2,s3].
La méta-analyse de tests immunochromatographiques chez l’enfant a inclus 12 études et 4 407 participants; elle conclut à une bonne précision diagnostique chez les enfants présentant une gastro-entérite aiguë, sans remplacer l’interprétation clinique et épidémiologique [s7].
Valeurs de référence
| Catégorie qualitative [s6] | Résultat attendu et signification analytique [s5,s6] |
|---|---|
| Négatif / non détecté [s5,s6] | Aucun antigène rotavirus détecté dans la selle dans les limites de l’immunoessai; résultat attendu chez une personne sans antigène détectable [s5,s6]. |
| Positif / détecté [s5,s6] | Antigène rotavirus détecté dans la selle; résultat compatible avec une présence de rotavirus et à interpréter avec le contexte clinique, la qualité du prélèvement et les autres agents recherchés [s3,s5]. |
| Équivoque ou invalide [s6] | Catégorie non fournie comme résultat universel par LOINC; si la notice de l’essai prévoit une zone équivoque ou un contrôle invalide, suivre la règle du fabricant et du laboratoire [s6]. |
Pour cet examen qualitatif, il n’existe pas d’intervalle biologique chiffré à appliquer; le résultat attendu est une catégorie ordinale de présence ou d’absence d’antigène [s5,s6].
Le laboratoire fait foi pour la méthode, les contrôles, la catégorie de résultat et les règles de validation propres à l’immunoessai utilisé [s3,s6].
Aucune valeur de référence ou performance spécifiquement établie pour une population d’Afrique subsaharienne n’a été fournie par les sources consultées; donnée non disponible [s1,s7].
Chez l’enfant, le résultat attendu reste qualitatif — détecté ou non détecté — et non une plage de référence dépendant de l’âge [s5,s6].
La revue systématique des tests antigéniques chez l’enfant a rapporté une sensibilité groupée de 89,2 % (intervalle de confiance à 95 % : 77,4–95,3 %) et une spécificité groupée de 93,2 % (intervalle de confiance à 95 % : 83,8–97,3 %); ces performances ne sont pas des valeurs de référence et dépendent des études et des essais inclus [s7].
Seuils de décision et gravité
Aucun seuil décisionnel universel en unité quantitative n’est applicable à l’antigène rotavirus qualitatif; LOINC 5880-0 décrit une échelle ordinale de présence, et le seuil interne éventuel dépend de l’immunoessai [s6].
L’OMS rapporte, pour les immunoessais enzymatiques évalués dans son cadre de surveillance, une sensibilité de 75–82 % et une spécificité de 100 %; le CDC rapporte pour les kits EIA une sensibilité approximative de 90–100 %. Ces estimations divergent selon les kits et les populations et ne doivent pas être utilisées comme seuils individuels [s1,s3].
La méta-analyse des tests immunochromatographiques chez l’enfant rapporte une sensibilité groupée de 89,2 % et une spécificité groupée de 93,2 %; les estimations de sous-groupes sont de 87,1 % et 91,8 % chez les enfants âgés de 5 ans ou moins, et de 92,3 % et 95,2 % dans les études de haute qualité. Ces chiffres décrivent des performances d’études, non un intervalle de référence du laboratoire [s7].
Le seuil analytique propre au réactif utilisé au laboratoire Africa Medical Data est non disponible dans les sources consultées [s1,s3,s6].
Interprétation
Un résultat négatif ou non détecté signifie qu’aucun antigène rotavirus n’a été détecté dans la selle par l’essai utilisé; cela ne constitue pas une valeur diminuée au sens d’un dosage quantitatif [s5,s6].
Un résultat faussement négatif reste possible, notamment lorsque la quantité de virus est faible ou inférieure au niveau de détection de l’immunoessai [s1].
Si la suspicion clinique ou épidémiologique persiste malgré un résultat négatif, la pertinence d’une autre méthode ou d’un nouveau prélèvement relève du laboratoire et du contexte clinique; aucune conduite individuelle n’est déduite de cette fiche [s1,s3].
Un résultat positif ou détecté signifie que l’antigène rotavirus est présent dans la selle selon l’immunoessai; MedlinePlus décrit la présence de rotavirus dans les selles comme compatible avec une infection à rotavirus [s5].
La détection antigénique doit être interprétée avec les symptômes et les autres causes possibles de gastro-entérite, car les manifestations cliniques seules ne distinguent pas le rotavirus des autres pathogènes [s3,s4,s7].
Un résultat positif d’immunoessai n’identifie pas le génotype; la caractérisation des souches nécessite des méthodes moléculaires spécialisées [s1,s3].
Facteurs qui faussent le résultat
La selle entière est le prélèvement préféré; l’OMS déconseille de privilégier les écouvillons rectaux ou les écouvillons placés dans un milieu bactérien pour la détection ou la caractérisation du rotavirus [s1].
Dans une étude de surveillance chez des enfants ayant une gastro-entérite aiguë, la détection par EIA était de 49 % dans les selles entières contre 27 % avec les écouvillons rectaux; la quantité moindre de matière fécale sur écouvillon peut réduire la sensibilité de l’EIA [s8].
Recueillir la selle pendant la diarrhée, dans un récipient propre ou stérile, et empêcher le mélange avec l’urine; aucune préparation spéciale ni jeûne n’est requis [s1,s5].
Pour la surveillance hospitalière, prélever dans les 48 heures suivant l’admission; ce délai vise à limiter l’identification d’une infection nosocomiale et ne constitue pas un délai général de rendu du test [s1].
La conservation doit respecter les conditions documentées: 4–8 °C temporairement jusqu’à un mois, éviter les cycles congélation-décongélation, et −70 °C si une conservation prolongée est nécessaire [s1].
Les performances varient selon la méthode: le CDC décrit l’EIA comme la méthode antigénique la plus largement disponible, tandis que l’immunochromatographie, la PCR et les panels multipathogènes ont des profils analytiques distincts [s3].
La RT-PCR peut détecter de plus petites quantités de virus que l’EIA; dans l’étude comparative, elle a détecté du rotavirus chez 18 % des témoins sains alors que l’EIA n’en a détecté aucun, ce qui complique l’interprétation clinique d’une détection moléculaire isolée [s8].
Les cycles de congélation-décongélation et le stockage prolongé peuvent réduire la quantité de virus ou d’antigène détectable; l’étude comparative précise que les échantillons avaient été conservés 8 ans et que ces conditions pouvaient affecter davantage l’EIA [s8].
Sources
- World Health Organization (WHO). Rotavirus (2018)
- Centers for Disease Control and Prevention (CDC). Clinical Overview of Rotavirus (2024)
- Julia M. Baker, Jacqueline E. Tate, Rashi Gautam, Umesh D. Parashar; CDC. Chapter 13: Rotavirus (2025)
- LeClair CE. Rotavirus (2023)
- MedlinePlus, U.S. National Library of Medicine. Rotavirus antigen test (2024)
- LOINC, Regenstrief Institute. LOINC 5880-0 Rotavirus Ag [Presence] in Stool by Immunoassay (2026)
- Hung PJ, et al.. Diagnostic accuracy of rotavirus antigen tests in children: A systematic review and meta-analysis (2023)
- Stockman LJ, Staat MA, Holloway M, et al.. Optimum Diagnostic Assay and Clinical Specimen for Routine Rotavirus Surveillance (2008)