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Culture d'expectoration

Examen biologique : Microbiologie bactérienne. La culture d’expectoration recherche, dans un échantillon de mucus provenant des poumons ou des voies aériennes, des bactéries ou d’autres germes pouvant contribuer à une infection respiratoire. L’échantillon doit être une expectoration obtenue par toux profonde et non de la salive; le résultat est interprété avec la qualité du prélèvement et le contexte clinique.

À quoi sert cet examen

  • Rechercher des bactéries ou d’autres germes pouvant être responsables d’une infection des poumons ou des voies aériennes [s1,s4,s6].
  • Contribuer à l’évaluation d’affections respiratoires telles que la pneumonie, la tuberculose ou la bronchectasie lorsque le clinicien recherche une cause infectieuse [s1,s6].
  • Chez l’adulte hospitalisé, les recommandations ATS/IDSA ne préconisent pas la culture d’expectoration de façon systématique en ambulatoire; elles recommandent un prélèvement avant traitement dans certaines situations, notamment pneumonie communautaire sévère, traitement empirique visant le SARM ou Pseudomonas aeruginosa, antécédent de ces agents, ou hospitalisation avec antibiotiques parentéraux dans les 90 jours précédents [s2].

Valeurs de référence

Examen qualitatif: l’attendu est un résultat de culture (« négatif/normal » ou « positif/anormal »), et non un intervalle biologique chiffré [s1,s6].

Résultat [s1,s6]Signification générale [s1,s6]
Négatif/normal [s1,s6]Aucune bactérie ou autre germe nuisible n’a été trouvé dans l’échantillon [s1,s6]
Positif/anormal [s1,s6]Une bactérie ou un autre germe potentiellement nuisible a été trouvé; le compte rendu peut nommer le germe détecté et en indiquer la quantité [s1,s6]

Interprétation

Un résultat négatif signifie que la culture n’a pas trouvé de bactérie ou d’autre germe nuisible dans l’échantillon; il doit être lu en tenant compte de la qualité du prélèvement et de l’exposition antérieure aux antibiotiques, qui influencent le rendement [s1,s2,s5].

Un résultat positif signifie qu’une bactérie ou un autre germe potentiellement nuisible a été trouvé dans l’échantillon; le laboratoire rapporte le germe détecté et sa quantité, et l’interprétation tient compte de la qualité de l’expectoration et des autres données disponibles [s6].

La présence d’un germe dans une expectoration ne constitue pas à elle seule un diagnostic: la qualité du prélèvement, le type et la quantité de germe, la coloration de Gram, le contexte hospitalier et les autres examens doivent être pris en compte [s6].

Facteurs qui faussent le résultat

L’expectoration n’est pas équivalente à la salive; une contamination salivaire ou par écoulement post-nasal peut réduire la représentativité de l’échantillon [s1,s3,s6].

Les antibiotiques peuvent modifier la croissance bactérienne et les résultats; les recommandations indiquent aussi que le rendement varie selon une antibiothérapie préalable, le germe et le contexte [s1,s2,s5].

Les recommandations ATS/IDSA soulignent que le rendement dépend de l’ensemble du processus: recueil, transport, traitement rapide, critères cytologiques et interprétation [s2].

Si une toux profonde ne permet pas d’obtenir suffisamment de mucus, une bronchoscopie peut être utilisée pour recueillir directement un prélèvement des voies aériennes par brossage ou aspiration [s1,s6].

Chez l’enfant, une étude de recueil d’expectoration induite décrit l’utilisation des cellules épithéliales salivaires comme marqueur de contamination des voies respiratoires supérieures et des cellules purulentes comme élément de qualité; ces observations pédiatriques ne remplacent pas les critères du laboratoire local [s3].

Sources

  1. MedlinePlus. Sputum Culture: MedlinePlus Medical Test (2026)
  2. Metlay JP, Waterer GW, Long AC, et al.. Diagnosis and Treatment of Adults with Community-acquired Pneumonia. An Official Clinical Practice Guideline of the American Thoracic Society and Infectious Diseases Society of America (2019)
  3. Grant LR, Hammitt LL, Murdoch DR, et al.. Procedures for Collection of Induced Sputum Specimens From Children (2012)
  4. MedlinePlus. Bacteria Culture Test: MedlinePlus Medical Test (2026)
  5. Mandell LA, Wunderink RG, Anzueto A, et al.. Infectious Diseases Society of America/American Thoracic Society Consensus Guidelines on the Management of Community-Acquired Pneumonia in Adults (2007)
  6. Cleveland Clinic. Sputum Culture (2023)