Culture de bile
Examen biologique : Microbiologie bactérienne. La culture de bile est un examen microbiologique qui recherche la croissance de bactéries, de virus ou de champignons dans un échantillon biliaire. Elle est utilisée pour contribuer à l'évaluation microbiologique des infections des voies biliaires, avec un résultat dépendant de la méthode de prélèvement et du laboratoire.
À quoi sert cet examen
Les prélèvements biliaires peuvent être obtenus directement au site infectieux lors d'une ERCP ou d'un drainage percutané; une étude rétrospective décrit leur intérêt pour détecter les agents microbiens et caractériser les profils de résistance du centre étudié [s2].
Dans une cohorte rétrospective de 1 063 patients atteints de cholangite, la culture de bile a été réalisée chez 384 patients et était positive dans 84,4 % des cas, contre 35 % pour les hémocultures; la croissance polymicrobienne était de 59,3 % dans la bile et de 13,5 % dans le sang [s1]. Ces proportions sont propres à cette cohorte et ne constituent pas un intervalle de référence universel [s1].
La microbiologie des infections biliaires varie selon le type d'infection, l'origine communautaire ou associée aux soins et la présence d'un stent biliaire [s6].
Valeurs de référence
La culture de bile est un examen qualitatif; le laboratoire qui réalise l'analyse fait foi pour la méthode, le type de milieu, la durée d'incubation et la population concernée [s5].
| Contexte [s5] | Résultat attendu [s5] |
|---|---|
| Résultat négatif [s5] | Aucune bactérie, aucun virus et aucun champignon ne pousse dans le milieu de culture [s5] |
Interprétation
Une croissance de bactéries, de champignons ou de virus dans le milieu est un résultat anormal compatible avec une infection du système biliaire, mais ne suffit pas à elle seule à établir un diagnostic [s5].
Dans l'étude de Kaya menée sur des prélèvements obtenus par ERCP, 46 cultures sur 91 étaient positives (50,5 %); les microorganismes les plus fréquemment isolés étaient Escherichia coli (28,2 %), Pseudomonas (17,3 %) et Stenotrophomonas maltophilia (15,2 %) [s3]. Ces fréquences décrivent cette population étudiée et ne sont pas des valeurs de référence [s3].
Dans l'étude de Zhao, 267 cultures biliaires étaient positives et 280 souches ont été isolées; 76,8 % étaient Gram négatif, 22,5 % Gram positif et 0,7 % des champignons [s2]. Ces résultats sont spécifiques au centre et à la population étudiés [s2].
Facteurs qui faussent le résultat
La préparation dépend de la méthode utilisée pour obtenir la bile; l'ERCP et la chirurgie de la vésicule biliaire sont deux modalités décrites par la source destinée aux patients [s5].
La présence de microorganismes dans la bile n'implique pas nécessairement une infection active; dans une étude de patients avec infection biliaire, certains isolats biliaires n'étaient pas concordants avec le sang et une culture biliaire persistait après amélioration clinique [s4].
Lors d'une étude par ERCP, la bile était aspirée avant l'injection de produit de contraste, puis transportée dans des flacons d'hémoculture et un système de transport anaérobie; 17 prélèvements ont été exclus pour aspiration inadéquate [s3].
Les profils microbiologiques peuvent différer selon la région et la période; la revue consultée signale aussi un profil particulier dans les voies biliaires porteuses de stent [s2,s6].
Sources
- John Titus George et al.. Bile Culture May Guide Antibiotic Stewardship in Acute Bacterial Cholangitis (2024)
- Chenwei Zhao, Shanshan Liu, Xue Bai, Jitao Song, Qiaowei Fan, Jing Chen. A Retrospective Study on Bile Culture and Antibiotic Susceptibility Patterns of Patients with Biliary Tract Infections (2022)
- Muhsin Kaya, Remzi Beştaş, Fatma Bacalan, Ferhat Bacaksız, Esma Gülsun Arslan, Mehmet Ali Kaplan. Microbial profile and antibiotic sensitivity pattern in bile cultures from endoscopic retrograde cholangiography patients (2012)
- Ji Won Park, Jong Kyun Lee, Kyu Taek Lee, Kwang Hyuk Lee, Young Kyung Sung, Cheol-In Kang. How to interpret the bile culture results of patients with biliary tract infections (2014)
- UCSF Health. Bile culture (2025)
- Esther Nve, Josep M. Badia, Mireia Amillo-Zaragüeta, Montserrat Juvany, Mónica Mourelo-Fariña, Rosa Jorba. Early Management of Severe Biliary Infection in the Era of the Tokyo Guidelines (2023)