Culture de pus

À quoi sert cet examen

La culture de pus sert à rechercher et identifier les bactéries présentes dans un prélèvement purulent provenant d’une plaie, d’un abcès ou d’un drainage; le test de culture bactérienne peut utiliser un prélèvement de peau ou d’un autre tissu selon le site [s5].

Pour les abcès et les carbuncles, la recommandation IDSA indique que la coloration de Gram et la culture du pus sont recommandées [s1].

Le résultat peut être complété par une étude de sensibilité afin d’évaluer la sensibilité de la bactérie isolée à différents antibiotiques; l’identification et la sensibilité dépendent des résultats et des indications du laboratoire [s5].

L’OMS décrit des méthodes standardisées d’identification bactérienne et d’étude de sensibilité, avec contrôle qualité, pour plusieurs bactéries d’importance de santé publique [s6].

Valeurs de référence

Examen qualitatif: aucune plage de référence chiffrée ne s’applique. Le compte rendu peut indiquer une croissance ou une absence de croissance; en cas de croissance, il peut identifier les microorganismes jugés cliniquement significatifs et ajouter une étude de sensibilité lorsqu’elle est indiquée [s5].

Seuils de décision et gravité

Aucun seuil critique ou seuil d’alerte chiffré n’a été retenu pour cet examen dans les sources consultées [s1,s5].

Interprétation

Une absence de croissance ne permet pas à elle seule d’évaluer la qualité du prélèvement: la récupération peut être influencée par le type de prélèvement, la technique microbiologique, le délai ou le transport; le manuel CDC indique aussi que le pus seul peut ne pas donner de croissance au repiquage [s2,s4].

Un prélèvement inadéquat, reçu dans un contenant ou un milieu de transport inapproprié, ou reçu après un délai prolongé peut ne pas fournir un résultat valide ou complet [s4].

La croissance de bactéries dans le prélèvement doit être interprétée avec le site, le type de plaie, les informations cliniques et les signes de contamination; les plaies sont souvent colonisées et un écouvillon superficiel peut recueillir des contaminants qui ne reflètent pas les microorganismes plus profonds [s2,s4].

Une culture positive peut conduire à l’identification des microorganismes cliniquement significatifs et, lorsque cela est indiqué, à une étude de sensibilité [s5].

Facteurs qui faussent le résultat

Nettoyer ou débrider la surface et retirer les exsudats superficiels avant le prélèvement afin de réduire la contamination; privilégier le tissu viable ou l’aspiration de la partie la plus profonde du pus [s4].

Pour le pus, l’aspiration profonde dans un tube stérile est recommandée par le guide de prélèvement; pour une plaie ouverte, le prélèvement doit viser la base ou la marge évolutive après nettoyage, en évitant les zones nécrotiques [s4].

Les écouvillons sont moins préférables que l’aspirat ou le tissu; lorsqu’un écouvillon est inévitable, les sources recommandent de limiter le prélèvement aux plaies cliniquement infectées ou non cicatrisantes, et le guide Henry Ford demande deux écouvillons pour permettre la coloration de Gram [s2].

Les écouvillons, tissus et aspirats doivent être placés dans un milieu ou contenant approprié et transmis rapidement au laboratoire; un prélèvement pour recherche d’anaérobies doit préserver les conditions anaérobies pendant le transport [s3,s4].

Le site, le type de plaie, le caractère traumatique ou chirurgical et les traitements antimicrobiens en cours doivent accompagner la demande, car les résultats doivent être interprétés avec ces informations [s2,s4].

Sources

1. Stevens DL et al.. Practice Guidelines for the Diagnosis and Management of Skin and Soft Tissue Infections: 2014 Update by the Infectious Diseases Society of America (2014)
2. Bowler PG, Duerden BI, Armstrong DG. Wound Microbiology and Associated Approaches to Wound Management (2001)
3. Ramsay S, Cowan L, Davidson JM, Nanney L, Schultz G. Wound samples: moving towards a standardised method of collection and analysis (2015)
4. Miller JM; Centers for Disease Control. Handbook of Specimen Collection and Handling in Microbiology (1985)
5. MedlinePlus; U.S. National Library of Medicine. Bacteria Culture Test (2024)
6. World Health Organization; Perilla M et al., editors. Manual for the laboratory identification and antimicrobial susceptibility testing of bacterial pathogens of public health importance in the developing world (2003)