Culture d'écouvillon nasal
Examen biologique : Microbiologie bactérienne. La culture d'écouvillon nasal est une culture bactérienne aérobie d'un prélèvement des narines externes; le catalogue de laboratoire consulté l'utilise notamment pour rechercher Streptococcus pyogenes et Staphylococcus aureus. Elle peut documenter un portage nasal de S. aureus, qui peut être asymptomatique, mais un résultat positif ne suffit pas à établir une infection. Pour une suspicion de rhinosinusite bactérienne aiguë, les cultures nasopharyngées sont jugées peu fiables et la recommandation IDSA privilégie une culture obtenue par aspiration sinusienne directe.
À quoi sert cet examen
- La culture peut contribuer à documenter le portage nasal de Staphylococcus aureus, dont les narines antérieures constituent un site fréquent de colonisation [s3].
- Une étude de dépistage a utilisé des écouvillons nasaux appariés, dont l'un était soumis à la culture, pour rechercher la colonisation par S. aureus chez des nouveau-nés et des adultes [s4].
- Dans la rhinosinusite bactérienne aiguë suspectée, la culture d'un écouvillon nasopharyngé ne doit pas être utilisée comme équivalent d'une culture du sinus: l'IDSA recommande l'aspiration sinusienne directe chez les patients non répondeurs et juge les cultures nasopharyngées peu fiables [s2].
- La synthèse de l'American Family Physician reprend la préférence pour l'aspiration sinusienne directe et la non-recommandation des cultures nasopharyngées pour le diagnostic microbiologique de la rhinosinusite bactérienne aiguë [s5].
Interprétation
Une culture négative ne doit pas être transformée en conclusion diagnostique. Dans l'étude comparant culture et PCR sur écouvillon nasal, la culture a présenté une sensibilité inférieure à la PCR dans les groupes néonatal et adulte, et des écouvillons positifs par PCR n'ont pas été positifs par culture dans l'analyse initiale [s4].
Une croissance bactérienne doit être interprétée selon le microorganisme identifié et le contexte clinique; la détection de S. aureus dans un écouvillon nasal peut correspondre à une colonisation, car la colonisation nasale peut être asymptomatique [s3,s4].
Facteurs qui faussent le résultat
La CDC recommande, pour les prélèvements respiratoires nasaux décrits dans sa procédure, l'emploi d'un écouvillon stérile et le placement immédiat de l'écouvillon dans le tube de transport prévu; pour un prélèvement nasal antérieur, elle décrit une rotation contre la paroi nasale dans chaque narine [s1].
Dans l'étude de Paule et collaborateurs, la culture de S. aureus à partir d'écouvillons nasaux a utilisé des milieux sélectifs et une incubation de 24 à 48 heures; ce protocole expérimental ne doit pas être généralisé à tous les laboratoires [s4].
Sources
- Centers for Disease Control and Prevention. Interim Guidelines for Collecting and Handling of Clinical Specimens for COVID-19 Testing (2024)
- Chow AW, Benninger MS, Brook I, et al.. IDSA Clinical Practice Guideline for Acute Bacterial Rhinosinusitis in Children and Adults (2012)
- Sakr A, Brégeon F, Mège J-L, Rolain J-M, Blin O. Staphylococcus aureus Nasal Colonization: An Update on Mechanisms, Epidemiology, Risk Factors, and Subsequent Infections (2018)
- Paule SM, Pasquariello AC, Hacek DM, et al.. Direct Detection of Staphylococcus aureus from Adult and Neonate Nasal Swab Specimens Using Real-Time Polymerase Chain Reaction (2004)
- Lambert M. IDSA Releases Guidelines for Management of Acute Bacterial Rhinosinusitis (2013)