Culture mycobactérienne

À quoi sert cet examen

La culture consiste à faire croître les mycobactéries sur un milieu solide ou liquide; le CDC recommande de cultiver tous les spécimens, indépendamment du résultat du frottis [s1].

Pour le diagnostic de la tuberculose, la culture est la référence de confirmation en laboratoire; une culture positive pour Mycobacterium tuberculosis confirme la maladie, tandis qu’une culture négative ne l’exclut pas nécessairement [s1].

Pour l’isolement des mycobactéries, la revue de microbiologie indique qu’un milieu liquide associé à au moins un milieu solide est essentiel; le bouillon permet une croissance et une détection plus rapides, tandis que le milieu solide contribue à récupérer des souches rares qui ne croissent pas dans le bouillon [s3].

Dans une étude rétrospective chinoise portant sur 1 676 expectorations de patients suspects de tuberculose pulmonaire, le système BACTEC MGIT 960 a détecté 818 cultures positives sur 1 676 (48,8 %) contre 692 sur 1 676 (41,3 %) avec le milieu de Löwenstein–Jensen; le délai moyen de détection était de 11,78 ± 5,16 jours contre 24,17 ± 8,73 jours [s4].

Seuils de décision et gravité

Résultat attendu qualitatif: culture positive ou culture négative; pour Mycobacterium tuberculosis, une culture positive confirme la tuberculose, mais une culture négative ne l’exclut pas nécessairement [s1].

Facteurs qui faussent le résultat

Pour les spécimens cliniques destinés au diagnostic de la tuberculose, le guide canadien demande un récipient stérile, étanche et approuvé par le laboratoire; le transport doit être rapide et, s’il ne peut pas avoir lieu dans l’heure, le spécimen doit être conservé entre 2 et 8 °C, non congelé et protégé de la lumière [s5].

Le guide APHL comprend des rubriques d’évaluation du traitement des spécimens, de l’inoculation et de la détection de croissance; il demande aussi de surveiller et d’évaluer la qualité du système analytique et de documenter la compétence du personnel avant le travail autonome [s2].

Pour les mycobactéries non tuberculeuses, la revue distingue une croissance lente, nécessitant plus de 7 jours pour produire des colonies matures sur milieu solide dans des conditions idéales, et une croissance rapide, produisant des colonies matures en 7 jours ou moins sur un milieu approprié [s3].

Les résultats comparant le système BACTEC MGIT 960 et le milieu de Löwenstein–Jensen proviennent d’une étude d’expectorations chez des patients suspects de tuberculose pulmonaire et ne décrivent pas toutes les méthodes de culture mycobactérienne [s4].

Sources

1. Centers for Disease Control and Prevention. Clinical and Laboratory Diagnosis for Tuberculosis (2024)
2. Association of Public Health Laboratories. Mycobacterium tuberculosis: Assessing Your Laboratory (2019)
3. Betty A. Forbes, Geraldine S. Hall, Melissa B. Miller, Susan M. Novak, Marie-Claire Rowlinson, Max Salfinger, Akos Somoskövi, David M. Warshauer, Michael L. Wilson. Practical Guidance for Clinical Microbiology Laboratories: Mycobacteria (2018)
4. Ping Zhao, Qin Yu, Liang Chen, Man Zhang. Evaluation of a liquid culture system in the detection of mycobacteria at an antituberculosis institution in China; A retrospective study (2016)
5. Marcel A. Behr, Simon Grandjean Lapierre, Dennis Y. Kunimoto, Robyn S. Lee, Richard Long, Inna Sekirov. Chapter 3 of the Canadian Tuberculosis Standards: Diagnosis of tuberculosis disease and drug-resistant tuberculosis (2022)