Culture de prélèvement osseux

Examen biologique : Microbiologie bactérienne. La culture d’un prélèvement osseux recherche et isole un microorganisme à partir d’un échantillon osseux ou tissulaire profond; la biopsie osseuse avec culture est décrite comme le critère diagnostique de référence de l’ostéomyélite dans les sources consultées. Elle peut fournir l’identification du microorganisme et des données de sensibilité lorsqu’elles sont obtenues par le laboratoire, mais l’interprétation dépend de la qualité du prélèvement, du transport et d’une éventuelle antibiothérapie préalable.

À quoi sert cet examen

La culture d’un prélèvement osseux contribue à rechercher l’agent infectieux dans l’os atteint et à l’identifier; la biopsie osseuse et les cultures microbiennes offrent un diagnostic définitif dans la revue clinique consultée. [s4]
La biopsie osseuse, ouverte ou percutanée, est décrite comme utile pour établir le diagnostic histopathologique, identifier le microorganisme causal et fournir des données de sensibilité qui orientent le traitement antimicrobien. [s5]
En cas de suspicion d’ostéomyélite du pied liée au diabète, la recommandation consultée privilégie un prélèvement osseux plutôt qu’un prélèvement de tissu mou, réalisé par voie peropératoire ou percutanée. [s2]
Une culture osseuse positive peut aider à déterminer le microorganisme causal, mais la culture d’un prélèvement superficiel ou d’un trajet fistuleux ne doit pas remplacer systématiquement le prélèvement osseux, car ces échantillons peuvent être contaminés ou peu concordants avec l’os. [s3,s5,s6]

Valeurs de référence

Résultat rapporté	Interprétation analytique
Aucune croissance détectée [s1]	Aucun microorganisme n’a été récupéré dans les conditions de culture appliquées; ce résultat peut être influencé par l’antibiothérapie préalable, un échantillonnage inadéquat ou un problème de transport. [s1,s2]

Interprétation

L’absence de croissance peut être observée après une exposition antimicrobienne, lorsque le prélèvement ne provient pas de la zone infectée, ou lorsque la collecte, le contenant ou le transport ne permettent pas la récupération du microorganisme. [s1,s2,s3]
Une culture négative n’exclut donc pas à elle seule une atteinte osseuse lorsque la qualité du prélèvement ou le contexte pré-analytique est défavorable. [s1,s2,s4]

Une croissance à partir d’un prélèvement osseux profond obtenu de manière aseptique peut permettre d’identifier le microorganisme associé à l’atteinte osseuse et de réaliser, lorsque cela est indiqué, une étude de sensibilité. [s2,s5]
Dans la revue clinique consultée, Staphylococcus aureus est le microorganisme le plus fréquemment identifié dans l’ostéomyélite; cette observation ne remplace pas l’identification réalisée sur le prélèvement du patient. [s4]
Une croissance issue d’un écouvillon superficiel ou d’un trajet sinusal peut correspondre à une colonisation ou à une contamination et ne reflète pas nécessairement le microorganisme présent dans l’os. [s3,s5]

Facteurs qui faussent le résultat

Échantillon: privilégier un fragment d’os ou de tissu profond obtenu de façon aseptique, par voie percutanée à travers une peau intacte et non infectée ou pendant l’intervention; les écouvillons sont inférieurs au tissu ou au liquide lorsque ceux-ci peuvent être obtenus. [s2,s3,s5]
Prélèvement avant antimicrobiens: recueillir les échantillons de culture avant l’administration d’un antimicrobien lorsque cela est possible. [s1]
Antimicrobiens avant biopsie: la recommandation IDSA sur l’ostéomyélite vertébrale indique qu’une interruption de 1 à 2 semaines peut être raisonnable lorsque la situation le permet, mais qu’il ne faut pas retarder les antimicrobiens en cas de sepsis imminent, d’instabilité hémodynamique ou de compromis neurologique. [s1]
La durée sans antimicrobien n’est pas uniforme entre les sources: la recommandation du pied diabétique évoque une période de quelques jours et idéalement 2 semaines, tandis que StatPearls mentionne 48 à 72 heures avant une biopsie ouverte comme pouvant augmenter le rendement sans être systématiquement nécessaire. [s2,s5]
Contamination: éviter le passage par un ulcère ou un trajet sinusal lorsque cela est possible; les flores cutanées ou la colonisation superficielle peuvent produire des résultats trompeurs. [s2,s3,s5]
Analyses complémentaires: pour une ostéomyélite vertébrale subaiguë ou chronique, ou selon les facteurs épidémiologiques et de l’hôte, les recommandations consultées proposent d’ajouter des cultures fongiques, mycobactériennes ou brucelliennes; dans l’étude sur l’ostéomyélite chronique, les cultures aérobies et anaérobies ainsi que les recherches mycobactériennes et fongiques étaient envisagées lorsque le contexte clinique le justifiait. [s1,s3]
Facteurs analytiques: le volume de tissu ou d’aspirat, le niveau réellement échantillonné, l’aiguille utilisée et l’exposition antimicrobienne préalable peuvent modifier la sensibilité de la culture ou son exactitude. [s1]

Sources

Infectious Diseases Society of America. 2015 Infectious Diseases Society of America (IDSA) Clinical Practice Guidelines for the Diagnosis and Treatment of Native Vertebral Osteomyelitis in Adults (2015)
Infectious Diseases Society of America and International Working Group on the Diabetic Foot. IWGDF/IDSA Guidelines on the Diagnosis and Treatment of Diabetes-related Foot Infections (2023)
Vemu L, et al.. Need for appropriate specimen for microbiology diagnosis of chronic osteomyelitis (2018)
Bury DC, Rogers TS, Dickman MM. Osteomyelitis: Diagnosis and Treatment (2021)
Momodu II, et al.. Osteomyelitis (2023)
Ulusoy S, Kılınç İ, Coşkun B, Ayhan M. Are Deep Tissue Cultures a Reliable Alternative to Bone Biopsy for Diagnosing Diabetic Foot Osteomyelitis? A Comparative Diagnostic Study (2025)