Détection de MRSA/SARM
Examen biologique : Microbiologie bactérienne. La détection de MRSA/SARM recherche Staphylococcus aureus résistant à la méticilline dans un prélèvement au moyen d’une culture, d’une méthode moléculaire, ou d’une combinaison des deux selon l’algorithme du laboratoire. Elle est utilisée notamment pour le dépistage et la prévention de la transmission en contexte de soins, mais l’interprétation dépend de la cible moléculaire, du site prélevé et de la méthode utilisée.
À quoi sert cet examen
La détection est demandée pour obtenir une identification rapide de MRSA dans les programmes de dépistage et de contrôle des infections [s1].
Les approches décrites associent, selon le protocole, un enrichissement et une culture sur milieu sélectif, une PCR ciblant S. aureus et des déterminants de résistance tels que mecA et mecC, puis une confirmation par une autre méthode ou par culture [s1,s2].
L’écouvillon nasal est utilisé pour rechercher un portage, mais des prélèvements provenant d’autres sites peuvent améliorer la détection de la colonisation [s5,s7].
Valeurs de référence
| Résultat [s1] | Lecture analytique [s1] |
|---|---|
| Détecté [s1,s2] | Détection compatible avec la présence de MRSA par la méthode employée; certains protocoles prévoient une confirmation par culture ou par une méthode complémentaire [s1,s2]. |
| Non détecté [s1,s3,s6] | MRSA non détecté par la méthode utilisée; un résultat négatif peut ne pas couvrir mecC ou certaines variantes si l’essai ne les cible pas ou si les amorces ne les reconnaissent pas [s3,s6]. |
Interprétation
Un résultat « non détecté » signifie que MRSA n’a pas été détecté par la méthode et le prélèvement analysés; l’écouvillon nasal seul peut manquer une colonisation présente sur d’autres sites [s3,s7].
Les tests moléculaires limités à mecA peuvent manquer des isolats porteurs de mecC, et des variants de la séquence ciblée peuvent également produire un résultat faussement négatif [s2,s3,s6].
Un résultat « détecté » indique que la méthode a identifié une combinaison de marqueurs ou de caractéristiques compatible avec MRSA; il ne précise pas à lui seul le site d’origine ni le contexte clinique [s1,s2].
Un test PCR nasal peut rester positif lorsque de l’ADN provenant d’organismes non viables est détecté, notamment pendant une antibiothérapie anti-MRSA; un résultat positif de dépistage nasal n’est donc pas nécessairement confirmatoire d’une culture clinique positive [s4].
Facteurs qui faussent le résultat
La couverture des cibles est déterminante: les protocoles ciblant mecA ne détectent pas nécessairement mecC, et les essais commerciaux ne couvrent pas tous cette cible [s2,s3,s6].
La diversité des éléments SCCmec et des sites de liaison des amorces peut entraîner un résultat négatif avec une PCR à cible unique malgré la présence d’un isolat résistant [s3,s6].
Le type d’écouvillon peut modifier les performances d’une méthode moléculaire de détection de MRSA [s5].
Le site de prélèvement influence la détection: un prélèvement nasal seul peut être moins sensible qu’une combinaison de sites chez des personnes colonisées [s7].
Une antibiothérapie anti-MRSA préalable peut réduire la sensibilité de la culture d’un écouvillon nasal, tandis que la PCR peut détecter l’ADN d’organismes non viables [s4].
Sources
- Nijhuis RHT, van Maarseveen NM, van Hannen EJ, et al.. A Rapid and High-Throughput Screening Approach for Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus Based on the Combination of Two Different Real-Time PCR Assays (2014)
- Kerschner H, Harrison EJ, Hartl R, et al.. First report of mecC MRSA in human samples from Austria: molecular characteristics and clinical data (2015)
- Paterson GK, Morgan FJE, Harrison EM, et al.. Prevalence and characterization of human mecC methicillin-resistant Staphylococcus aureus isolates in England (2013)
- Feng C, Hwang H, Vuong NN, et al.. Evaluation of methicillin-resistant Staphylococcus aureus nasal swab screening at a large comprehensive cancer center (2024)
- Dalpke AH, Hofko M, Stock C, et al.. Evaluation of the BD Max MRSA XT Assay for Use with Different Swab Types (2014)
- Becker K, Larsen AR, Skov R, et al.. Evaluation of a Modular Multiplex-PCR Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus Detection Assay Adapted for mecC Detection (2013)
- Lee C-S, Montalmont B, O’Hara JA, et al.. Screening for Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus Colonization Using Sponges (2015)