PCR Candida spp.

Examen biologique : Parasitologie et mycologie. La PCR Candida spp. est une méthode moléculaire qualitative qui recherche l’ADN de Candida dans le sang et a été étudiée comme aide au diagnostic de la candidémie et de la candidose invasive. Les résultats publiés montrent une variabilité selon l’essai et la population; la PCR est décrite comme un complément des méthodes conventionnelles plutôt que comme un remplacement universel de la culture.

À quoi sert cet examen

La PCR recherche et amplifie des séquences d’ADN de Candida dans le sang; les travaux publiés l’évaluent pour la détection de Candida spp. chez des patients avec suspicion de candidémie ou de candidose invasive. [s1,s2,s4,s6,s7]

Contribuer à la détection moléculaire de Candida dans le sang lorsque la candidémie est suspectée. [s1,s2,s4,s7]
Compléter la culture sanguine : la méta-analyse de PCR directe dans le sang rapporte une positivité PCR de 85 % chez les patients avec candidose invasive prouvée ou probable, contre 38 % pour les hémocultures dans les études incluses. [s2]
Apporter un signal potentiellement plus précoce que la culture; une revue de l’Infectious Diseases Society of America indique que les tests PCR peuvent détecter la candidémie avant les hémocultures, tout en rappelant que leur valeur prédictive positive est limitée lorsque la prévalence est faible. [s4]
Le contexte clinique des recommandations internationales inclut surtout la candidémie et les autres formes invasives chez des patients immunodéprimés ou gravement malades; cette description ne constitue pas une indication universelle de PCR. [s5]

Valeurs de référence

Examen qualitatif : le compte rendu porte sur la détection ou la non-détection de Candida spp. dans l’échantillon analysé; les études de PCR rapportent la positivité ou la négativité du test. [s1,s2,s4,s6,s7]

Les performances publiées sont propres à chaque méthode et à sa population d’étude : l’étude prospective de Moreira-Oliveira et al. rapporte une sensibilité de 72,1 % et une spécificité de 91,2 % pour sa PCR avec séquençage; ces chiffres ne sont pas des valeurs de référence du laboratoire. [s1]

Facteurs qui faussent le résultat

Méthode d’amplification : dans une étude sur des échantillons sanguins, la PCR en temps réel a présenté une sensibilité de 81 % et une spécificité de 96 %, tandis que la PCR nichée a présenté une sensibilité de 86 % et une spécificité de 54 %; les méthodes ne sont donc pas interchangeables. [s6]
Contamination analytique : l’étude comparative indique que la PCR en temps réel évite le risque de contamination par les amplicons et les étapes post-PCR chronophages décrits pour la PCR nichée. [s6]
Cible et protocole : les essais publiés utilisent des cibles et des amorces différentes; Moreira-Oliveira et al. ont amplifié les régions ITS5 et ITS4 puis séquencé les produits pour identifier Candida spp., tandis que Khan et al. ont comparé une PCR spécifique du genre à des PCR nichées spécifiques d’espèce. [s1,s7]
Interprétation : les taux de positivité de la PCR et de l’hémoculture diffèrent dans les études de candidose invasive; les tests non culturels doivent être interprétés avec le contexte clinique et les autres données microbiologiques, car leur valeur prédictive positive dépend de la prévalence. [s2,s4]
Comparabilité : les résultats de performance de l’essai multiplex Fungiplex étudié chez des patients de réanimation sont spécifiques à ce kit et à cette comparaison avec l’hémoculture; ils ne doivent pas être transposés à une PCR Candida spp. différente. [s3]

Sources

Moreira-Oliveira MS et al.. Diagnosis of candidemia by polymerase chain reaction and blood culture: prospective study in a high-risk population and identification of variables associated with development of candidemia (2005)
Avni T et al.. PCR diagnosis of invasive candidiasis: systematic review and meta-analysis (2011)
Fuchs S et al.. Diagnostic Performance of a Novel Multiplex PCR Assay for Candidemia among ICU Patients (2019)
Clancy CJ et al.. Finding the ‘missing 50%’ of invasive candidiasis: how nonculture diagnostics will improve understanding of disease spectrum and transform patient care (2013)
Cornely OA et al.. Global guideline for the diagnosis and management of candidiasis: an initiative of the ECMM in cooperation with ISHAM and ASM (2025)
Khlif M et al.. Evaluation of nested and real-time PCR assays in the diagnosis of candidaemia (2009)
Khan ZU et al.. Detection of Candida species by polymerase chain reaction (PCR) in blood samples of experimentally infected mice and patients with suspected candidemia (2001)