PCR Marburg (laboratoire de référence)
Examen biologique : Virologie et infections virales. La PCR Marburg est une NAAT qualitative destinée à rechercher l’ARN du virus Marburg dans un échantillon clinique, généralement le sang EDTA chez le patient vivant. La confirmation doit être interprétée avec les données cliniques et épidémiologiques et réalisée dans le circuit d’un laboratoire de référence; un résultat positif est rapporté comme détecté/positif et un résultat négatif comme non détecté/négatif.
À quoi sert cet examen
La NAAT, dont la RT-PCR, est l’approche préférée par l’OMS pour confirmer une infection à orthomarburgvirus; la RT-PCR recherche directement le matériel génétique viral et peut contribuer au diagnostic précoce. [s1,s5,s8]
- Examiner un cas suspect sur la base des éléments cliniques et épidémiologiques, en gardant à l’esprit que la maladie à virus Marburg peut être difficile à distinguer du paludisme, de la fièvre typhoïde, de la shigellose, de la méningite et d’autres fièvres hémorragiques virales. [s1,s3]
- Confirmer la présence d’un orthomarburgvirus par une NAAT spécifique d’espèce, ou par une détection pan-filovirus suivie d’une confirmation d’espèce par NAAT et/ou séquençage. [s1]
- Orienter le prélèvement vers le laboratoire de santé publique ou de référence désigné lorsque le test Marburg est nécessaire; le CDC demande de suivre les instructions de l’autorité sanitaire pour le prélèvement et l’expédition. [s4]
Les tests PCR amplifient une petite quantité de matériel génétique présent dans l’échantillon; pour un virus à ARN, la transcription inverse précède l’amplification. [s8] Une étude publiée de RT-PCR Marburg a ciblé des séquences du gène de la nucléoprotéine et a conclu que l’essai pouvait faciliter le diagnostic de cas suspects, mais ses performances restent propres à l’essai étudié. [s7]
Valeurs de référence
| Population ou situation [s1] | Résultat attendu [s1,s6] |
|---|---|
| Patient vivant testé pour une suspicion clinique/épidémiologique [s1] | Non détecté / négatif ou détecté / positif selon la présence de l’ARN cible; aucun intervalle chiffré n’est applicable. [s1,s6] |
| Cas symptomatique avec NAAT positive [s1] | Détecté / positif; la guidance OMS le classe comme cas aigu confirmé dans sa définition de laboratoire. [s1] |
Le laboratoire émetteur fait foi pour la méthode, la plateforme, les contrôles, la matrice et les règles de validation; le code LOINC 86574-1 décrit une observation qualitative dans le sang et non une plage de référence. [s6]
Aucun intervalle de référence chiffré spécifique à une population africaine n’est applicable ou fourni pour cette PCR qualitative; le résultat attendu reste détecté/positif ou non détecté/négatif selon la méthode validée. [s1,s6]
Aucun intervalle pédiatrique chiffré n’est applicable à cette PCR qualitative. Chez le nourrisson, l’OMS indique qu’un prélèvement capillaire au talon peut être envisagé si le prélèvement veineux n’est pas faisable, avec une sensibilité attendue réduite. [s1]
Seuils de décision et gravité
Aucun seuil chiffré de positivité, de charge virale ou de valeur critique n’est fourni pour ce test qualitatif. Le code LOINC décrit la présence de l’ARN par NAA avec sonde et ne définit pas de seuil clinique universel. [s1,s6]
Lorsque la plateforme fournit une valeur Cq/Ct, elle doit être interprétée avec prudence, ne doit pas être comparée directement entre essais, plateformes, laboratoires ou types de spécimens, et ne doit pas être utilisée comme mesure directe de l’infectiosité. [s1]
Interprétation
Un résultat non détecté/négatif signifie que l’ARN cible n’a pas été détecté dans le spécimen analysé avec la méthode utilisée; il ne constitue pas un intervalle biologique bas. [s1,s6]
En cas de suspicion clinique et épidémiologique persistante, un résultat négatif peut nécessiter une réévaluation, car un échantillon de mauvaise qualité, une manipulation, un transport ou un stockage inadéquats, un échec d’extraction de l’ARN ou une diversité de séquence dans la région ciblée peuvent contribuer à un faux négatif. [s1]
Si le premier prélèvement sanguin d’un patient vivant a été réalisé dans les 72 heures suivant le début des symptômes et que le test est négatif, l’OMS recommande un second test sur un nouveau prélèvement sanguin réalisé plus de 72 heures après le début des symptômes. [s1]
Un résultat détecté/positif indique la détection de l’ARN du virus Marburg dans le spécimen par la méthode utilisée; il ne s’exprime pas en concentration ni en intervalle de référence. [s1,s6]
Chez un patient symptomatique, une NAAT positive correspond à la catégorie de cas aigu confirmé dans la définition de laboratoire de l’OMS; l’interprétation complète doit intégrer les éléments cliniques et épidémiologiques. [s1]
Une détection pan-filovirus positive doit être suivie d’une confirmation d’espèce par NAAT et/ou séquençage, sauf si une NAAT spécifique d’espèce a déjà fourni la confirmation prévue par la stratégie. [s1]
Facteurs qui faussent le résultat
Le sang EDTA est le spécimen recommandé chez le patient vivant; le sang capillaire au talon peut être utilisé chez le nourrisson lorsque le prélèvement veineux n’est pas faisable, mais une sensibilité réduite est attendue. [s1]
Les écouvillons sanguins secs peuvent entraîner une perte importante de sensibilité; l’écouvillonnage oral n’est pas recommandé pour le diagnostic chez le patient vivant, car les concentrations d’ARN viral sont généralement plus faibles dans ce type de prélèvement que dans le sang. [s1]
Chez le défunt, l’écouvillon oral est le spécimen préféré; l’écouvillonnage nasopharyngé n’est pas recommandé par l’OMS, car la probabilité de détection du virus n’est pas bien établie. [s1]
La qualité du prélèvement, la manipulation, l’expédition, le stockage, l’extraction de l’ARN, la performance technique et la diversité de séquence de la région ciblée peuvent influencer un résultat NAAT et générer un faux négatif. [s1]
Les valeurs Cq/Ct dépendent notamment du type et de la qualité du spécimen, des conditions de transport ou de stockage, des volumes utilisés, de la plateforme et des réactifs, de l’efficacité d’extraction et de RT-PCR, de l’expertise du personnel, de la validation, des inhibiteurs et d’une contamination par des désinfectants ou d’autres inhibiteurs. [s1]
Les échantillons non inactivés présentent un risque biologique extrême; l’OMS recommande leur traitement sous des conditions de confinement biologique maximal, et le CDC demande la coordination avec l’autorité sanitaire et le laboratoire de santé publique pour les instructions de prélèvement et d’expédition. [s2,s4]
Les résultats devraient idéalement être disponibles dans les 24 à 48 heures suivant le prélèvement afin de soutenir la prise en charge et les mesures de santé publique; ce délai est une cible de la guidance OMS et non une garantie de rendu local. [s1]
Les performances analytiques publiées pour un essai RT-PCR particulier, y compris sa cible et sa spécificité sur les séquences testées, ne doivent pas être transposées comme seuil ou intervalle universel à une autre plateforme. [s7]
Sources
- World Health Organization. Diagnostic testing for Ebola disease and Marburg virus disease: interim guidance, 9 July 2026 (2026)
- World Health Organization. Marburg virus disease (2025)
- Centers for Disease Control and Prevention. Clinical Overview of Marburg Virus Disease (2025)
- Centers for Disease Control and Prevention, Laboratory Outreach Communication System. Guidance for Marburg Virus Disease Specimen Testing (2023)
- Soni S. Marburg Virus Disease (2025)
- LOINC Committee, Regenstrief Institute. 86574-1: Marburg virus RNA [Presence] in Blood by NAA with probe detection (2026)
- Park SW, Lee YJ, Lee WJ, Jee Y, Choi W. One-Step Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction for Ebola and Marburg Viruses (2016)
- MedlinePlus, U.S. National Library of Medicine. PCR Tests (2026)