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PCR Plasmodium falciparum

Examen biologique : Parasitologie et mycologie. La PCR de Plasmodium falciparum est un examen moléculaire qualitatif qui recherche l’ADN de P. falciparum dans le sang et rend un résultat détecté ou non détecté. Elle peut compléter la microscopie ou un test diagnostique rapide pour confirmer l’espèce, notamment lorsque l’identification microscopique est incertaine, mais son délai peut limiter son rôle dans la prise en charge immédiate.

À quoi sert cet examen

La PCR détecte les acides nucléiques parasitaires dans le sang et peut identifier l’espèce Plasmodium ; le code LOINC 41447-4 correspond à la présence d’ADN de P. falciparum dans le sang par amplification d’acide nucléique avec détection par sonde [s1,s6].

Elle est surtout utile pour confirmer l’espèce après une microscopie ou un test diagnostique rapide ayant établi une infection palustre, ou lorsque la morphologie ne permet pas une identification fiable [s1,s2,s4].

Les tests d’amplification des acides nucléiques permettent une détection sensible des infections de faible densité parasitaire, mais la PCR n’est pas une méthode rapide de première intention dans tous les contextes de soins [s1,s3,s5].

L’OMS recommande un diagnostic rapide du paludisme par microscopie ou test diagnostique rapide chez les personnes suspectes avant traitement ; cette fiche PCR décrit un examen moléculaire complémentaire et ne remplace pas cette recommandation générale [s3].

Valeurs de référence

Population [s6]Résultat attendu [s6]Unité / échelle [s6]
Adulte ; sang [s6]Non détecté / négatif lorsque l’ADN de P. falciparum n’est pas détecté ; détecté / positif lorsque l’ADN cible est détecté [s6]Qualitatif, sans unité numérique [s6]

Le résultat attendu est qualitatif et ne doit pas être remplacé par un intervalle de référence chiffré ; la méthode validée et les règles de rendu du laboratoire font foi [s1,s6].

Seuils de décision et gravité

Aucun seuil chiffré, seuil critique ou valeur de cycle de quantification (Ct) n’est fourni par les sources consultées pour ce test qualitatif ; non disponible [s1,s2,s6].

Facteurs qui faussent le résultat

Le prélèvement est du sang ; pour le protocole moléculaire CDC décrit, le sang total est recueilli sur EDTA, avant un traitement antiparasitaire, puis expédié à 4 °C [s2].

Dans le protocole CDC, 1–5 mL de sang sont demandés, les frottis doivent accompagner l’échantillon EDTA et la PCR est réalisée lorsque l’espèce ne peut pas être déterminée sur les frottis ; le volume et le circuit peuvent varier selon la méthode locale validée [s2].

La contamination croisée est une limite pré- ou analytique possible des méthodes moléculaires ; la revue décrit la nécessité d’espaces de travail séparés et d’un contrôle de la préparation, des réactifs et de l’analyse [s5].

Une PCR peut être plus sensible que la microscopie, mais ses résultats peuvent ne pas être disponibles assez rapidement pour le diagnostic d’un patient aigu dans un circuit standard [s1].

Un résultat négatif ne constitue pas à lui seul une exclusion universelle du paludisme : l’interprétation dépend de la méthode validée, de la qualité de l’échantillon et du contexte clinique ; les sources CDC et OMS maintiennent la place de la microscopie ou du test rapide pour le diagnostic initial [s1,s3].

La PCR ne mesure pas la parasitémie et ne remplace pas l’examen microscopique lorsqu’une estimation de la proportion d’hématies infectées est nécessaire ; la microscopie fournit cette information selon le CDC [s1].

Sources

  1. Centers for Disease Control and Prevention (CDC). Malaria Diagnostic Tests (2024)
  2. Centers for Disease Control and Prevention (CDC), DPDx. Blood Specimens – Molecular Diagnosis (2026)
  3. Organisation mondiale de la Santé (OMS/WHO). Diagnostic testing (2026)
  4. Johnston SP, Pieniazek NJ, Xing-Zhu Bai, et al.. PCR as a Confirmatory Technique for Laboratory Diagnosis of Malaria (2006)
  5. Calderaro A, Piccolo G, et al.. The Laboratory Diagnosis of Malaria: A Focus on the Diagnostic Applications of Molecular Methods (2024)
  6. Regenstrief Institute / LOINC Committee. LOINC 41447-4: Plasmodium falciparum DNA [Presence] in Blood by NAA with probe detection (2026)