PCR RSV/VRS

À quoi sert cet examen

Les symptômes cliniques du RSV sont non spécifiques et peuvent recouper d’autres infections respiratoires virales ou certaines infections bactériennes; un test de laboratoire peut confirmer l’infection [s1].

Les tests d’amplification des acides nucléiques, dont la rRT-PCR, sont décrits comme très sensibles pour détecter le RSV. Des tests moléculaires peuvent être utilisés chez les personnes plus âgées et les adultes, chez qui la quantité de virus dans le nez tend à être moindre que chez les nourrissons et les jeunes enfants [s1,s2].

Le dépistage du RSV est utilisé pour rechercher si ce virus explique des symptômes respiratoires modérés à sévères, notamment chez les nourrissons, les personnes âgées et les personnes immunodéprimées [s2]. Le CDC indique que les nourrissons, certains jeunes enfants, les personnes immunodéprimées et les adultes âgés ou présentant certains facteurs de risque sont plus exposés aux formes sévères [s6].

Dans la note technique de surveillance de l’OPS, le test moléculaire du RSV est présenté comme un diagnostic différentiel après exclusion de la grippe et du SARS-CoV-2 selon l’algorithme de laboratoire cité par cette note [s3].

Seuils de décision et gravité

Dans le protocole de détection moléculaire HRSV reproduit par l’OPS, « RSV RNA detected » est interprété comme positif pour le RSV, « RSV RNA not detected » comme négatif et « - - » comme résultat invalide [s3].

Facteurs qui faussent le résultat

Le type de prélèvement acceptable est fixé par l’essai utilisé. Selon le document ADLM, les échantillons possibles selon les essais et le siège de l’infection comprennent des écouvillons nasopharyngés, des écouvillons nasaux, des écouvillons de gorge et, pour certains panels de pneumonie, le liquide de lavage bronchoalvéolaire [s4].

Le document ADLM indique que l’âge peut intervenir dans le choix du prélèvement; l’aspirat nasal est traditionnellement préféré chez les jeunes enfants. Il rapporte aussi que les enfants ont une charge virale plus élevée que les adultes et que la détection tend donc à être plus fréquente dans cette population [s4].

Chez les personnes de plus de 65 ans, la diminution des sécrétions et la sécheresse nasale peuvent réduire la qualité du prélèvement. Une collecte sous-optimale peut diminuer la sensibilité; le type d’écouvillon influence également l’exactitude [s4].

Les échantillons de RSV devraient être prélevés pendant les premiers jours suivant le début des symptômes, car la quantité de virus dans le nez diminue avec le temps et peut rendre le résultat moins exact [s2].

Les tests moléculaires ont une sensibilité accrue et les bonnes pratiques de laboratoire doivent limiter la contamination, qui peut conduire à des résultats faussement positifs [s4].

La notice du test et le laboratoire doivent être consultés pour le type de spécimen, l’interprétation des résultats et les performances attendues de l’essai particulier [s1].

Une étude japonaise de validation a évalué les essais RT-PCR Pan-RSV et duplex sur 2 261 écouvillons nasopharyngés provenant de patients hospitalisés en pédiatrie âgés de moins de 15 ans [s5].

Sources

1. Centers for Disease Control and Prevention (CDC). Diagnostic Testing for RSV (2026)
2. U.S. National Library of Medicine. Respiratory Syncytial Virus (RSV) Tests (2025)
3. Pan American Health Organization (PAHO/OPS). Respiratory Syncytial Virus (RSV) laboratory diagnosis: Technical note (2023)
4. Berry GJ, Jhaveri TA, Larkin PMK, Mostafa H, Babady NE. ADLM Guidance Document on Laboratory Diagnosis of Respiratory Viruses (2024)
5. Suwa R, Kume Y, Kawase M, et al.. Practical Validation of United States Centers for Disease Control and Prevention Assays for the Detection of Human Respiratory Syncytial Virus in Pediatric Inpatients in Japan (2022)
6. Centers for Disease Control and Prevention (CDC). Clinical Overview of RSV (2025)