Recherche de Campylobacter spp.
Examen biologique : Microbiologie bactérienne. La recherche de Campylobacter spp. vise à mettre en évidence le microorganisme dans un prélèvement clinique, le plus souvent des selles, par isolement en culture ou par une méthode indépendante de la culture selon la méthode disponible. Elle est particulièrement pertinente lorsque la diarrhée s’accompagne de fièvre, de sang ou de mucus dans les selles, de crampes abdominales importantes ou de signes de sepsis, ainsi que pour l’investigation d’épisodes groupés.
À quoi sert cet examen
L’examen recherche un agent entérique Campylobacter dans les selles et contribue à l’identification étiologique d’une diarrhée lorsque les signes cliniques ou le contexte justifient un examen microbiologique. [s1,s5]
- La recherche de Campylobacter est recommandée dans les selles en présence de fièvre, de selles sanglantes ou mucoïdes, de crampes ou d’une sensibilité abdominale importante, ou de signes de sepsis. [s6]
- L’identification d’un isolat peut contribuer à la surveillance, à l’investigation d’une source commune et à la caractérisation publique des infections; une culture de confirmation après un test indépendant de la culture permet aussi d’obtenir un isolat pour la sensibilité aux antimicrobiens et le séquençage lorsque cela est nécessaire. [s1,s5,s7]
- La culture est une méthode conventionnelle de détection, mais les tests moléculaires ou antigéniques peuvent donner des résultats plus rapides; les tests moléculaires multiplex peuvent être plus sensibles que les méthodes conventionnelles pour plusieurs agents, dont Campylobacter. [s4,s5,s7]
- Pour l’échange interopérable, HL7 FHIR R4 modélise le résultat élémentaire avec la ressource Observation; son type est un CodeableConcept et l’Observation peut référencer le Specimen utilisé. [s8]
Valeurs de référence
| Résultat attendu [s5,s7] | Description [s5,s7] |
|---|---|
| Non détecté / non isolé [s5,s7] | Aucun Campylobacter spp. n’est détecté ou isolé par la méthode appliquée dans l’échantillon analysé. [s5,s7] |
Il n’existe pas d’intervalle chiffré applicable à cette recherche qualitative; le résultat doit être interprété avec la méthode, le prélèvement et le contexte clinique. [s6,s7]
Interprétation
Un résultat négatif n’exclut pas toujours la présence de Campylobacter: la bactérie est exigeante, sensible aux environnements riches en oxygène et sa récupération diminue lorsque le prélèvement, le transport ou les conditions de culture sont inadaptés. [s2,s7]
La culture conventionnelle est orientée vers les espèces les plus courantes et certains antimicrobiens des milieux sélectifs peuvent inhiber d’autres espèces; une méthode moléculaire peut donc détecter des cibles non récupérées par la culture. [s3,s4,s7]
Un résultat de culture positif correspond à l’isolement de Campylobacter spp. dans le prélèvement; les colonies suspectes sont examinées et l’identification est confirmée selon les méthodes du laboratoire. [s2,s7]
Une culture de confirmation peut fournir un isolat nécessaire à des essais de sensibilité aux antimicrobiens ou à la caractérisation épidémiologique lorsque ces examens sont requis. [s5,s6,s7]
Facteurs qui faussent le résultat
- Prélèvement: préférer une selle diarrhéique liquide ou semi-molle; un échantillon formé, mélangé à l’urine, un écouvillon sec, un prélèvement contenant du baryum, un contenant fuyant ou un prélèvement congelé peuvent justifier un rejet. [s6,s7]
- Transport: le prélèvement doit être acheminé aussi rapidement que possible; l’APHL recommande de ne pas dépasser quatre jours depuis le prélèvement, car la récupération de l’isolat diminue. Ne pas congeler les selles brutes et limiter l’exposition à l’oxygène ambiant. [s7]
- Conservation: si plus de deux heures se sont écoulées depuis le prélèvement, utiliser un milieu Cary-Blair modifié; pour une culture de confirmation, le document APHL indique une conservation à 2–8 °C selon le protocole applicable. [s7]
- Culture: l’isolement demande un milieu sélectif et une atmosphère microaérophile. Les géloses sélectives doivent être incubées 48–72 heures à 42 °C dans des conditions atmosphériques contrôlées; une incubation aérobie, un bocal à bougie ou une atmosphère contenant seulement 5–10 % de CO₂ ne sont pas des conditions acceptables pour cet isolement. [s2,s7]
- Espèces: l’incubation à 42 °C favorise C. jejuni mais peut manquer C. upsaliensis; les espèces moins courantes peuvent nécessiter d’autres milieux, une autre température ou un enrichissement. [s7]
- Enrichissement: dans une étude de 320 selles, l’ajout d’un enrichissement a augmenté de 30 % la détection au-delà de l’ensemencement direct sur CCDA seul; cette donnée appartient à la méthode et à la population étudiées et ne constitue pas une performance universelle. [s3]
- Interprétation des méthodes alternatives: les tests d’amplification ou les panels multiplex détectent de l’ADN et pas nécessairement un microorganisme viable; un résultat positif doit donc être interprété avec les données cliniques et, lorsque requis, complété par une culture. [s4,s6]
Sources
- Humphries RM; Linscott AJ. Practical Guidance for Clinical Microbiology Laboratories: Diagnosis of Bacterial Gastroenteritis (2015)
- Senok A; Botta G. Campylobacter enteritis in the Arabian Gulf (2009)
- Maher M; Collins E; Ward B et al.. Evaluation of Culture Methods and a DNA Probe-Based PCR Assay for Detection of Campylobacter Species in Clinical Specimens of Feces (2003)
- Binnicker MJ. Multiplex Molecular Panels for Diagnosis of Gastrointestinal Infection: Performance, Result Interpretation, and Cost-Effectiveness (2015)
- Centers for Disease Control and Prevention. Clinical Overview of Campylobacter (2026)
- Shane AL; Mody RK; Crump JA et al.. 2017 Infectious Diseases Society of America Clinical Practice Guidelines for the Diagnosis and Management of Infectious Diarrhea (2017)
- Association of Public Health Laboratories. Campylobacter Isolation and Characterization from Clinical Specimens: Guidance for Public Health Laboratories (2023)
- HL7 International. Observation - FHIR v4.0.1 (2026)