Recherche de Neisseria gonorrhoeae
Examen biologique : Microbiologie bactérienne. La recherche de Neisseria gonorrhoeae est un examen qualitatif visant à détecter cette bactérie dans un prélèvement adapté au site anatomique exposé; les tests d’amplification des acides nucléiques (NAAT) sont couramment utilisés pour cette détection. Le résultat doit être interprété avec le site et le type de prélèvement, la méthode et les limites analytiques de l’essai, sans constituer à lui seul un diagnostic.
À quoi sert cet examen
Cet examen recherche la présence de Neisseria gonorrhoeae dans un prélèvement clinique; les NAAT sont généralement utilisés pour le dépistage de N. gonorrhoeae et leur sensibilité et spécificité sont décrites comme élevées dans la recommandation consultée [s3,s6].
La recherche peut être envisagée chez des personnes asymptomatiques ou symptomatiques lorsque le dépistage ou l’évaluation d’une infection gonococcique est indiqué; les recommandations distinguent notamment les populations et les sites d’exposition, et les infections peuvent être asymptomatiques [s1,s2,s3].
- Le prélèvement doit correspondre au site d’exposition évalué; les types cités par la source consultée comprennent l’urine, les prélèvements endocervicaux, vaginaux, urétraux masculins, rectaux et pharyngés [s1,s3].
- Chez les hommes ayant des relations sexuelles avec des hommes, le CDC recommande un dépistage aux sites anatomiques d’exposition; la recommandation cite l’urètre, le rectum et le pharynx [s1,s2].
Pour la structuration interopérable, FHIR R4 décrit Observation comme une ressource pour les mesures et assertions simples, avec un statut, un code d’observation et une valeur lorsque celle-ci est présente [s4].
Pour le prélèvement, FHIR R4 décrit Specimen avec le type de matériau, le site et la méthode de collecte, ainsi que les informations de réception et de traitement; ces éléments structurent le dossier mais ne fixent pas une valeur clinique de référence [s5].
Valeurs de référence
| Population [s3] | Résultat qualitatif attendu [s3,s6] | Unité [s3,s6] | Commentaire [s1,s3,s6] |
|---|---|---|---|
| Toute population testée [s3] | Non détecté / négatif [s3,s6] | Sans unité [s3,s6] | Le résultat est qualitatif; la méthode validée, le prélèvement et le site anatomique conditionnent l’interprétation [s1,s3,s6]. |
Aucun intervalle numérique, facteur de conversion ou seuil universel n’a été retenu pour cet examen qualitatif; le laboratoire fait foi pour la méthode, le type de prélèvement, la population et les modalités de rendu [s1,s3,s6].
Interprétation
Un résultat « non détecté » indique que la cible n’a pas été détectée dans le prélèvement analysé; il ne renseigne que sur le prélèvement et la méthode utilisés [s1,s3,s6].
Un résultat non détecté peut être limité par un site anatomique non échantillonné, un prélèvement inadéquat ou les performances propres à l’essai; les sources consultées soulignent l’importance des sites d’exposition et des différences entre tests [s1,s3,s6,s8].
Un résultat « détecté » indique que la cible de N. gonorrhoeae a été détectée dans le prélèvement par la méthode utilisée; il doit être rapporté avec le site, le type d’échantillon et la méthode [s1,s3,s6].
Dans les sites extragénitaux, la présence d’autres espèces de Neisseria peut entraîner une réaction croisée selon la cible et l’essai; une confirmation par une méthode ou une cible indépendante peut donc être nécessaire selon le contexte et le protocole du laboratoire [s6,s7].
Facteurs qui faussent le résultat
- Le choix du site de prélèvement doit suivre le site d’exposition évalué; les infections pharyngées et rectales peuvent être asymptomatiques et ne sont pas représentées par un prélèvement provenant d’un autre site [s1,s2,s3].
- Les NAAT et leurs cibles diffèrent selon les plateformes; des réactions croisées avec d’autres espèces de Neisseria ont été rapportées, particulièrement dans les sites extragénitaux [s6].
- La valeur prédictive d’un résultat positif dépend du contexte de prévalence; des résultats positifs peuvent nécessiter une confirmation par une méthode ou une cible indépendante lorsque le protocole le prévoit [s6,s7].
- Les résultats doivent suivre les recommandations de la méthode utilisée; une étude comparative a décrit des différences de cibles, de plateformes et de performance entre systèmes [s6,s8].
- Le dossier de prélèvement devrait conserver le type de matériau, le site, la méthode de collecte, l’heure de collecte et la réception ou le traitement lorsque ces éléments sont disponibles, conformément aux éléments de Specimen FHIR R4 [s5].
Sources
- Centers for Disease Control and Prevention (CDC). Gonococcal Infections Among Adolescents and Adults — STI Treatment Guidelines, 2021 (2021)
- Centers for Disease Control and Prevention (CDC). STI Screening Recommendations (2021)
- US Preventive Services Task Force. Screening for Chlamydia and Gonorrhea: US Preventive Services Task Force Recommendation Statement (2021)
- HL7 International. Observation — FHIR v4.0.1 (2019)
- HL7 International. Specimen — FHIR v4.0.1 (2019)
- Tabrizi SN, Unemo M, Limnios A, et al.. Evaluation of Six Commercial Nucleic Acid Amplification Tests for Detection of Neisseria gonorrhoeae and Other Neisseria Species (2011)
- Moncada J, Schachter J, Liska S, et al.. Evaluation of Self-Collected Glans and Rectal Swabs from Men Who Have Sex with Men for Detection of Chlamydia trachomatis and Neisseria gonorrhoeae by Use of Nucleic Acid Amplification Tests (2009)
- Levett PN, Brandt K, Olenius K, et al.. Evaluation of Three Automated Nucleic Acid Amplification Systems for Detection of Chlamydia trachomatis and Neisseria gonorrhoeae in First-Void Urine Specimens (2008)