Recherche de Pneumocystis jirovecii
Examen biologique : Parasitologie et mycologie. La recherche de Pneumocystis jirovecii est un examen qualitatif de sécrétions bronchopulmonaires fondé sur l’identification microscopique du microorganisme, notamment dans une expectoration induite ou un lavage bronchoalvéolaire. Le résultat attendu est une présence détectée ou non détectée dans un prélèvement des voies respiratoires inférieures, selon la méthode validée par le laboratoire.
À quoi sert cet examen
Le CDC DPDx indique que le diagnostic spécifique repose sur l’identification de Pneumocystis jirovecii dans des sécrétions bronchopulmonaires obtenues par expectoration induite ou lavage bronchoalvéolaire; l’identification microscopique peut utiliser des colorations montrant les noyaux des trophozoïtes et les formes intracystiques, ou la paroi des kystes [s1].
Le CDC DPDx indique que la microscopie en immunofluorescence utilisant des anticorps monoclonaux peut identifier les organismes avec une sensibilité supérieure à celle de la microscopie conventionnelle [s1].
Dans l’étude publiée par les CDC chez des patients avec ou sans sida, un cas confirmé reposait sur un résultat positif par coloration de Gomori-Grocott, coloration au bleu de toluidine ou immunofluorescence dans un liquide de lavage bronchoalvéolaire ou une expectoration induite [s6].
Le chapitre StatPearls de NCBI précise que cette recherche microscopique nécessite l’examen d’une expectoration ou d’un liquide de lavage bronchoalvéolaire, avec obtention de ces prélèvements seulement lorsqu’elle est sûre [s3].
La revue de White, Backx et Barnes décrit le diagnostic comme fondé sur l’examen microscopique des prélèvements respiratoires et signale que des résultats faussement négatifs surviennent avec la microscopie [s4].
Valeurs de référence
| Résultat qualitatif [s2] | Résultat attendu et signification analytique [s2] |
|---|---|
| Détecté [s2] | Pneumocystis jirovecii est détecté dans l’échantillon des voies respiratoires inférieures par la méthode utilisée; la liste de réponses LOINC comprend « Detected » [s2]. |
| Non détecté [s2] | Pneumocystis jirovecii n’est pas détecté dans l’échantillon par la méthode utilisée; la liste de réponses LOINC comprend « Not detected » [s2]. |
Pour cet examen qualitatif, le résultat attendu est une catégorie de présence ou d’absence de détection; aucune concentration ni plage de référence numérique n’est applicable dans la fiche LOINC lue [s2].
Le laboratoire fait foi pour la méthode validée, la matrice acceptée, les contrôles et la catégorie finale du résultat; le code LOINC 88689-5 décrit une observation ordinale de présence/seuil par préparation au Calcofluor white [s2].
Facteurs qui faussent le résultat
La revue de White, Backx et Barnes indique que la microscopie n’est pas infaillible et que des résultats faussement négatifs peuvent survenir [s4].
Le CDC DPDx rapporte que l’immunofluorescence avec anticorps monoclonaux peut avoir une sensibilité supérieure à la microscopie conventionnelle; la méthode utilisée doit donc être associée au résultat rendu [s1].
Dans une étude menée chez des patients infectés par le VIH en Éthiopie, la sensibilité de la coloration au bleu de toluidine comparée à l’immunofluorescence était de 71,4 % dans l’expectoration et de 68 % dans les prélèvements de lavage bronchoalvéolaire; la spécificité était proche de 100 % dans les deux matrices [s5].
Sources
- Centers for Disease Control and Prevention (CDC), Division of Parasitic Diseases and Malaria. DPDx — Pneumocystis (2026)
- LOINC, Regenstrief Institute. LOINC 88689-5 — Pneumocystis jirovecii [Presence] in Lower respiratory specimen by Calcofluor white (2026)
- Truong J. Pneumocystis jirovecii Pneumonia (2023)
- White PL, Backx M, Barnes RA. Diagnosis and management of Pneumocystis jirovecii infection (2017)
- Aderaye G, Woldeamanuel Y, Asrat D, Lebbad M, Beser J, Worku A, Fernandez V, Lindquist L. Evaluation of Toluidine Blue O staining for the diagnosis of Pneumocystis jiroveci in expectorated sputum sample and bronchoalveolar lavage from HIV-infected patients in a tertiary care referral center in Ethiopia (2008)
- Centers for Disease Control and Prevention (CDC), Emerging Infectious Diseases. Pneumocystis jirovecii Pneumonia in Patients with or without AIDS, France (2014)