Recherche de mutation CALR
Examen biologique : Hématologie. La recherche de mutation CALR détecte principalement des insertions ou délétions de l’exon 9 et contribue à l’évaluation moléculaire des néoplasies myéloprolifératives, notamment la thrombocytémie essentielle et la myélofibrose primitive. Un résultat positif est un marqueur clonal et ne suffit pas, à lui seul, à établir un diagnostic; un résultat négatif n’exclut pas une néoplasie myéloproliférative.
À quoi sert cet examen
L’analyse recherche des mutations somatiques de CALR, généralement des insertions/délétions de l’exon 9, associées à des néoplasies myéloprolifératives. [s2,s3]
- Elle contribue à l’évaluation d’une suspicion de néoplasie myéloproliférative, en particulier de thrombocytémie essentielle ou de myélofibrose primitive; elle est informative lorsque les recherches JAK2 et MPL ne mettent pas de mutation en évidence. [s2]
- La présence d’une mutation CALR est l’un des critères majeurs de diagnostic de la thrombocytémie essentielle et de la myélofibrose primitive (classification OMS 2016); elle s’interprète avec les données cliniques et morphologiques. [s4,s5]
Seuils de décision et gravité
Les recommandations ICC rapportent une sensibilité analytique recommandée de 1 à 3 % pour les tests CALR/MPL; le seuil effectif dépend de la méthode utilisée et doit être consulté auprès du laboratoire exécutant. [s1]
Interprétation
En l’absence de mutation, la recherche de mutations JAK2 et MPL non canoniques peut être envisagée [s1]; le diagnostic de myélofibrose peut reposer sur un autre marqueur clonal ou sur l’exclusion d’une fibrose réactive [s4].
La détection d’une mutation CALR exon 9 est compatible avec un marqueur clonal observé notamment dans la thrombocytémie essentielle et la myélofibrose primitive; elle ne distingue pas à elle seule ces entités. [s2]
Facteurs qui faussent le résultat
- Les fréquences de CALR détectées varient avec la méthode: elles sont plus élevées avec l’analyse de fragments par capillaire ou le séquençage du génome qu’avec le séquençage direct, selon la sensibilité de détection [s3]. Des tests très sensibles sont recommandés (sensibilité de 1 à 3 % pour CALR et MPL) [s1].
- L’ADN peut être extrait de la moelle osseuse ou du sang périphérique. [s3]
Sources
- Daniel A. Arber; Attilio Orazi; Robert P. Hasserjian; et al.. International Consensus Classification of Myeloid Neoplasms and Acute Leukemias: integrating morphologic, clinical, and genomic data (2022)
- Tomasz Klampfl; Harald Gisslinger; Anna S. Harutyunyan; et al.. Somatic Mutations of Calreticulin in Myeloproliferative Neoplasms (2013)
- Jung-Sook Ha; Yu-Kyung Kim. Calreticulin Exon 9 Mutations in Myeloproliferative Neoplasms (2015)
- Sabrina Fowlkes; Cindy Murray; Adrienne Fulford; Tammy De Gelder; Nancy Siddiq. Myeloproliferative neoplasms (MPNs) – Part 1: An overview of the diagnosis and treatment of the “classical” MPNs (2018)
- Tiziano Barbui; Jürgen Thiele; Heinz Gisslinger; Hans Michael Kvasnicka; Alessandro M. Vannucchi; Paola Guglielmelli; Attilio Orazi; Ayalew Tefferi. The 2016 WHO classification and diagnostic criteria for myeloproliferative neoplasms: document summary and in-depth discussion (2018)