Recherche de mutation PML::RARA

À quoi sert cet examen

La détection génétique de la fusion PML::RARA confirme le diagnostic de LAP lorsqu’elle est présente; en cas de suspicion, les recommandations préconisent une confirmation au niveau génétique par un laboratoire expérimenté. [s1]

• La recherche est utilisée lors de l’évaluation diagnostique d’une LAP suspectée; les méthodes rapportées comprennent le caryotype, l’hybridation in situ en fluorescence (FISH), la RT-PCR et la RT-qPCR. [s1,s2]
• La RT-qPCR permet d’identifier et de quantifier les transcrits PML::RARA et sert au diagnostic ainsi qu’au suivi de la maladie résiduelle mesurable. [s2,s4]
• L’identification du type de transcrit à la présentation peut guider le choix de l’essai moléculaire utilisé ultérieurement pour le suivi. [s3,s5]
• Un résultat positif détecte la fusion/transcrit PML::RARA recherché; un résultat négatif signifie que la cible n’a pas été détectée par la méthode utilisée, mais ne permet pas à lui seul d’exclure toutes les réorganisations atypiques ou autres fusions de RARA. [s2,s6]

Le résultat attendu chez un échantillon sans transcrit PML::RARA détectable est qualitatif: négatif ou non détecté; un échantillon positif est rendu comme positif/détecté, avec quantification lorsque l’essai est quantitatif. [s2,s4,s5]

Valeurs de référence

Il n’existe pas d’intervalle de référence numérique applicable à cette recherche de fusion; pour un essai qualitatif, le résultat est rendu comme détecté/positif ou non détecté/négatif. Les unités et les seuils de quantification, s’il y en a, dépendent de l’essai du laboratoire exécutant. [s2,s5]

Seuils de décision et gravité

Aucun seuil numérique universel de décision n’est fourni ici pour la recherche qualitative de PML::RARA; les performances analytiques et critères de positivité propres à la méthode relèvent du laboratoire exécutant. [s1,s2]

Facteurs qui faussent le résultat

• Le prélèvement diagnostique peut être réalisé sur moelle osseuse ou sang périphérique; pour la recherche de maladie résiduelle, la moelle osseuse est généralement privilégiée en raison de sa meilleure sensibilité, bien que le sang périphérique puisse être utilisé dans des protocoles adaptés. [s2,s4]
• Les essais RT-qPCR usuels détectent les transcrits ciblés; des transcrits atypiques peuvent échapper aux amorces conventionnelles et nécessiter une approche complémentaire, telle qu’un séquençage ou un essai adapté. [s2]
• Une fusion cryptique peut ne pas être décelée par certaines approches cytogénétiques ou FISH; en présence d’une forte suspicion, l’association de méthodes complémentaires peut être nécessaire. [s2,s6]
• La qualité de l’ARN et celle de l’échantillon peuvent influer sur le résultat moléculaire; la RT-qPCR peut contribuer à reconnaître des échantillons de qualité insuffisante susceptibles de produire un faux négatif. [s3,s5]
• Aucune préparation particulière du patient n’est indiquée dans la ressource de test consultée; les exigences de prélèvement, de contenant, de conservation et d’acheminement doivent être confirmées auprès du laboratoire exécutant. [s5]

Sources

1. Miguel A. Sanz et al.. Management of acute promyelocytic leukemia: updated recommendations from an expert panel of the European LeukemiaNet (2019)
2. Lucas L. de Figueiredo-Pontes et al.. Diagnosis and management of acute promyelocytic leukemia (2024)
3. S. C. Bassi et al.. Molecular basis for the diagnosis and treatment of acute promyelocytic leukemia (2012)
4. Miguel A. Sanz et al.. Management of acute promyelocytic leukemia: updated recommendations from an expert panel of the European LeukemiaNet (2019)
5. Ornella Spinelli et al.. Simple, rapid and accurate molecular diagnosis of acute promyelocytic leukemia by loop mediated isothermal amplification technology (2015)
6. K. Karlin et al.. Cytogenetically cryptic PML::RARA fusion in acute promyelocytic leukemia (2022)