Recherche de Streptococcus pneumoniae
Examen biologique : Microbiologie bactérienne. La recherche de Streptococcus pneumoniae peut utiliser la culture, la détection antigénique ou une méthode moléculaire selon le prélèvement et la méthode retenue. L’isolement à partir d’un site normalement stérile est le principe général du diagnostic définitif, tandis qu’un test antigénique urinaire peut aider au diagnostic de la pneumonie pneumococcique chez l’adulte.
À quoi sert cet examen
La recherche aide à identifier S. pneumoniae lorsqu’une infection pneumococcique est suspectée. Le diagnostic définitif repose généralement sur l’isolement à partir d’un site normalement stérile; des tests antigéniques urinaires et des méthodes moléculaires sont également disponibles [s3,s4].
Dans le syndrome méningé, la confirmation de laboratoire peut utiliser la culture, la PCR ou la détection antigénique sur le liquide céphalorachidien; la culture est la première priorité pour la confirmation et l’isolement, mais sa sensibilité peut diminuer après une antibiothérapie préalable [s1].
La culture sanguine peut être utilisée pour diagnostiquer la méningite pneumococcique, la pneumonie et le sepsis; sa sensibilité est plus faible dans la pneumonie pneumococcique, car environ 10–15 % des cas sont bactériémiques [s1].
Chez l’adulte atteint de pneumonie communautaire, les recommandations ATS/IDSA suggèrent de ne pas réaliser systématiquement le test antigénique urinaire pneumococcique, sauf en cas de pneumonie sévère [s5].
**Échantillon** : Liquide céphalorachidien, sang ou liquide pleural selon le syndrome recherché; urine pour un test antigénique chez l’adulte atteint de pneumonie [s1,s3].
Valeurs de référence
| Méthode ou contexte [s1,s3,s4] | Résultat qualitatif attendu [s1,s3,s4] | Portée documentée [s1,s3,s4] |
|---|---|---|
| Culture d’un site normalement stérile [s1,s4] | S. pneumoniae isolé : culture positive [s1] | Un isolat provenant d’un site normalement stérile étaye le diagnostic définitif d’infection pneumococcique [s3,s4]. |
| PCR ou détection antigénique sur liquide céphalorachidien [s1] | S. pneumoniae identifié par PCR ou détection antigénique [s1] | Ces méthodes sont décrites pour la confirmation de la méningite pneumococcique sur liquide céphalorachidien [s1]. |
| Détection antigénique urinaire chez l’adulte atteint de pneumonie [s3,s5] | Antigène pneumococcique détecté [s3] | Le test urinaire peut aider au diagnostic de la pneumonie pneumococcique chez l’adulte [s3]. |
Facteurs qui faussent le résultat
- Une antibiothérapie administrée avant le prélèvement peut inhiber la culture; le liquide céphalorachidien doit être recueilli avant l’antibiothérapie lorsque cela est possible [s1].
- Les pneumocoques peuvent être isolés du nasopharynx de 5–90 % des personnes saines selon la population et le contexte; le portage ne conduit pas nécessairement à une maladie [s4].
- La différenciation de S. pneumoniae et des streptocoques viridans peut utiliser la sensibilité à l’optochine et la solubilité dans la bile. Les résultats du test d’optochine cités dans le manuel concernent un disque de 6 mm contenant 5 µg d’éthylhydrocupreine; pour un autre diamètre ou une autre concentration, il faut suivre les instructions du fabricant [s2].
- Chez des adultes ayant une insuffisance respiratoire aiguë avec suspicion de pneumonie, une méta-analyse de tests antigéniques urinaires a rapporté une sensibilité groupée de 0,66 (IC 95 % 0,62–0,69) et une spécificité groupée de 0,90 (IC 95 % 0,85–0,93) [s6].
- Dans une étude de 98 femmes adultes asymptomatiques, 24 (25 %) étaient colonisées par S. pneumoniae et 3 (3 %) avaient un test urinaire BinaxNOW positif [s7].
Sources
- Organisation mondiale de la Santé. Vaccine-Preventable Diseases Surveillance Standards: Pneumococcus (2018)
- World Health Organization; Centers for Disease Control and Prevention. Manual for the Laboratory Identification and Antimicrobial Susceptibility Testing of Bacterial Pathogens of Public Health Importance in the Developing World (2003)
- Centers for Disease Control and Prevention. About Pneumococcal Disease (2026)
- Centers for Disease Control and Prevention. Clinical Overview of Pneumococcal Disease (2026)
- Metlay JP, Waterer GW, Long AC, et al.. Diagnosis and Treatment of Adults with Community-acquired Pneumonia: An Official Clinical Practice Guideline of the American Thoracic Society and Infectious Diseases Society of America (2019)
- Yasuo S, Murata M, Nakagawa N, et al.. Diagnostic accuracy of urinary antigen tests for pneumococcal pneumonia among patients with acute respiratory failure suspected pneumonia: a systematic review and meta-analysis (2022)
- Turner P, Turner C, Jankhot A, et al.. A prospective study of urinary pneumococcal antigen detection in healthy Karen mothers with high rates of pneumococcal nasopharyngeal carriage (2011)