Recherche de toxine Shiga

À quoi sert cet examen

La recherche de toxine Shiga est utilisée, avec une culture d’E. coli O157, lorsque l’objectif est de rechercher une infection à STEC dans les selles; les approches recommandées détectent soit la toxine Shiga, soit les gènes qui l’encodent [s1,s2].

• La recherche de toxine permet de compléter la culture ciblant E. coli O157 afin de rechercher aussi des STEC non-O157 [s1,s2].
• Lorsque le contexte clinique ou épidémiologique évoque un organisme producteur de toxine Shiga, les recommandations demandent de distinguer E. coli O157:H7 des autres STEC et, si disponible, de distinguer les toxines Shiga 1 et Shiga 2 [s2].
• Pour un échange interopérable, HL7 FHIR R4 décrit Observation comme une ressource destinée aux mesures et assertions simples et DiagnosticReport comme le contexte d’un ensemble de résultats; cette référence structurelle ne fournit pas de valeur clinique [s7].

Valeurs de référence

• Examen qualitatif; résultat attendu : toxine Shiga non détectée / négatif lorsque la cible recherchée n’est pas détectée par la méthode utilisée [s1,s2].
• Un résultat détecté / positif indique que la méthode a détecté une toxine Shiga ou, lorsque la méthode est moléculaire, un gène qui l’encode; ces deux modalités ne mesurent pas la même cible [s1,s4,s6].

Interprétation

• Résultat non détecté / négatif : la cible recherchée n’est pas détectée par la méthode utilisée; il ne s’agit pas d’un intervalle numérique [s1,s2].
• Une non-concordance est possible entre une PCR positive pour un gène stx et une méthode immuno-enzymatique négative pour la toxine, notamment lorsque la production de toxine est insuffisante dans les conditions étudiées [s4,s6].

• Résultat détecté / positif : la toxine Shiga est détectée par le test utilisé; les spécimens positifs pour la toxine Shiga doivent être adressés à un laboratoire de santé publique pour caractérisation complémentaire selon le CDC [s1].
• La détection de toxine doit être rapprochée d’une culture d’E. coli O157 ou d’une méthode de détection des gènes de toxine lorsque cela est indiqué, car la recherche de toxine seule ne remplace pas la stratégie combinée recommandée [s1,s2,s3].

Facteurs qui faussent le résultat

• Le prélèvement optimal pour le diagnostic de la diarrhée infectieuse est une selle diarrhéique; si elle ne peut pas être recueillie rapidement, un écouvillon rectal peut être utilisé [s2].
• La PCR recherche l’ADN des gènes stx tandis que les immunoessais recherchent les toxines produites; leurs résultats peuvent donc ne pas concorder [s4,s6].
• Dans l’étude de Chui et al., les performances des immunoessais variaient entre l’examen direct des selles et l’utilisation d’une culture enrichie, et certains sous-types stx2 n’étaient pas identifiés par les immunoessais évalués; ces limites sont spécifiques aux méthodes étudiées [s5].
• Les techniques moléculaires sont généralement plus sensibles et moins dépendantes de la qualité du prélèvement que la culture, mais une détection moléculaire peut révéler de l’ADN sans démontrer nécessairement la présence d’un organisme viable [s2].
• Une étude de PCR multiplex a décrit une réactivité de certaines amorces stx avec des séquences d’Aeromonas; deux spécimens positifs pour stx1 contenaient A. hydrophila sans STEC isolé, ce qui constitue une limite de méthode à considérer [s3].
• La culture d’E. coli O157 et la recherche de toxine ou de gènes de toxine sont recommandées conjointement plutôt qu’une recherche de toxine isolée [s1,s2,s3].

Sources

1. Centers for Disease Control and Prevention. Information for Clinicians | E. coli infection (2024)
2. Shane AL, Mody RK, Crump JA, et al.. 2017 Infectious Diseases Society of America Clinical Practice Guidelines for the Diagnosis and Management of Infectious Diarrhea (2017)
3. Lefterova MI, Slater KA, Budvytiene I, et al.. A Sensitive Multiplex, Real-Time PCR Assay for Prospective Detection of Shiga Toxin-Producing Escherichia coli from Stool Samples Reveals Similar Incidences but Variable Severities of Non-O157 and O157 Infections in Northern California (2013)
4. Thilakarathna SH, Parsons B, Chui L, et al.. The Effect of Mitomycin C on Induction of Shiga Toxin Production in Clinical STEC Isolates (2025)
5. Chui L, Patterson-Fortin L, Kuo J, et al.. Evaluation of Enzyme Immunoassays and Real-Time PCR for Detecting Shiga Toxin-Producing Escherichia coli in Southern Alberta, Canada (2015)
6. Schindler EI, Sellenriek P, Storch GA, et al.. Shiga Toxin-Producing Escherichia coli: a Single-Center, 11-Year Pediatric Experience (2014)
7. HL7 International. Observation - FHIR v4.0.1 (2025)