Recherche de Ureaplasma spp.
Examen biologique : Microbiologie bactérienne. La recherche de Ureaplasma spp. est un examen microbiologique qualitatif qui peut être réalisé par culture ou par méthode moléculaire selon la méthode du laboratoire. Les données consultées indiquent que l’interprétation d’un résultat détecté doit tenir compte de la méthode, du prélèvement et du contexte clinique, car le rôle étiologique d’Ureaplasma reste décrit comme incohérent dans les recommandations CDC.
À quoi sert cet examen
La recherche vise à détecter Ureaplasma spp. dans un prélèvement clinique, par culture ou par amplification moléculaire selon la méthode employée [s1,s3].
Dans l’étude de Cunningham et al., la PCR ciblant Ureaplasma a été évaluée sur 283 prélèvements génito-urinaires et a permis de distinguer U. urealyticum de U. parvum, ce que la culture ne permet pas de la même manière [s3].
Les recommandations CDC indiquent que les données sont incohérentes concernant le rôle étiologique des espèces d’Ureaplasma dans l’urétrite et que la majorité des hommes porteurs n’ont pas de maladie apparente sauf en cas de charge élevée [s1]. La détection ne doit donc pas être présentée seule comme un diagnostic [s1].
Une étude sud-africaine a comparé une méthode phénotypique et une PCR multiplex pour les mycoplasmes génitaux dans des écouvillons de femmes enceintes; elle illustre que la méthode et le contexte de population influencent la concordance des résultats [s4].
Dans une étude menée chez 78 hommes symptomatiques, Ureaplasma spp. a été retrouvé dans 7 prélèvements par culture et 9 par PCR; ces résultats propres à cette population ne constituent pas une valeur de référence [s5].
Valeurs de référence
| Élément [s1,s3] | Résultat attendu [s1,s3] |
|---|---|
| Recherche qualitative de Ureaplasma spp. [s1,s3] | Détecté ou non détecté selon la méthode validée par le laboratoire [s1,s3] |
Aucun intervalle de référence chiffré n’a été retrouvé pour cet examen. Le laboratoire fait foi pour la méthode et la population de référence; en interopérabilité HL7 FHIR R4, une Observation peut porter un statut, un code et une valeur qualitative [s6].
Interprétation
Un résultat non détecté signifie que la cible n’a pas été détectée dans le prélèvement avec la méthode utilisée; il ne permet pas à lui seul d’exclure une détection par une autre méthode ou dans un autre prélèvement [s2,s3].
Les résultats discordants entre culture et PCR peuvent survenir; dans l’étude de Cunningham et al., des prélèvements étaient PCR positifs malgré une culture négative, et d’autres étaient PCR négatifs malgré une culture positive [s3].
Un résultat détecté indique la détection de Ureaplasma spp. dans le prélèvement analysé par la méthode utilisée; cette formulation ne constitue pas un diagnostic et ne préjuge pas du rôle causal de la détection [s1,s3].
La détection moléculaire peut distinguer U. urealyticum et U. parvum dans certains essais, alors que la culture et les méthodes phénotypiques n’apportent pas nécessairement la même résolution d’espèce [s3,s4].
Facteurs qui faussent le résultat
- La sensibilité comparative de la PCR et de la culture dépend de la cible PCR, des conditions de l’essai et de la méthode de culture [s1].
- Le type de prélèvement et son traitement comptent: l’étude génito-urinaire a utilisé des écouvillons et de l’urine en milieu de transport [s3]; dans l’étude néonatale, la disponibilité de surnageants plutôt que de culots cellulaires pouvait réduire la quantité d’ADN et contribuer à des résultats PCR faussement négatifs [s2].
- La culture de Ureaplasma repose sur des milieux particuliers; une étude néonatale rapporte une lecture du test de culture à 24–48 heures, tandis qu’une autre source décrit la culture comme laborieuse et chronophage, avec enrichissement pouvant aller jusqu’à sept jours avant sous-culture [s2,s4].
- La présence de Ureaplasma peut correspondre à une colonisation sans maladie apparente; le CDC souligne que les données sur son rôle étiologique dans l’urétrite sont incohérentes [s1].
- Les méthodes moléculaires peuvent apporter une identification d’espèce et ne dépendent pas de la viabilité de la bactérie, contrairement à la culture [s3,s4].
Sources
- Centers for Disease Control and Prevention. Urethritis and Cervicitis - STI Treatment Guidelines (2021)
- Cheah FC, Anderson TP, Darlow BA. Comparison of the Mycoplasma Duo Test with PCR for Detection of Ureaplasma Species in Endotracheal Aspirates from Premature Infants (2005)
- Cunningham SA, Mandrekar JN, Rosenblatt JE. Rapid PCR Detection of Mycoplasma hominis, Ureaplasma urealyticum, and Ureaplasma parvum (2013)
- Redelinghuys MJ, Ehlers MM, Dreyer A. Comparison of the new Mycofast Revolution assay with a molecular assay for the detection of genital mycoplasmas from clinical specimens (2013)
- Raykova V. Detection of common bacterial causes of urethritis in symptomatic men at the STD laboratory of MU-Sofia by microscopy, culture and NAAT (2019)
- HL7 International. FHIR R4: Observation (2019)