Test moléculaire de résistance à la rifampicine
Examen biologique : Microbiologie bactérienne. Les tests moléculaires rapides recommandés par l’OMS pour la détection initiale du complexe Mycobacterium tuberculosis et de la résistance à la rifampicine comprennent plusieurs classes et dispositifs, dont Xpert MTB/RIF, Xpert Ultra, Truenat et certains tests d’amplification des acides nucléiques automatisés de complexité modérée. Pour l’essai Xpert MTB/RIF, le CDC indique une détection simultanée du complexe Mycobacterium tuberculosis et de la résistance à la rifampicine en moins de 2 heures.
À quoi sert cet examen
L’OMS recommande d’utiliser des techniques rapides comme test diagnostique initial pour détecter le complexe Mycobacterium tuberculosis et la résistance à la rifampicine, afin de réduire le délai avant un traitement approprié [s2].
L’essai Xpert MTB/RIF détecte simultanément le complexe Mycobacterium tuberculosis et la résistance à la rifampicine ; le CDC indique que les résultats peuvent aider à sélectionner rapidement les schémas thérapeutiques et à prendre des décisions de contrôle de l’infection [s1].
Pour l’essai Xpert MTB/RIF, le CDC précise que le test ne remplace pas la microscopie des bacilles acido-alcoolo-résistants, la culture mycobactérienne, la sensibilité fondée sur la croissance ni le génotypage ; les prélèvements doivent rester disponibles pour ces examens recommandés [s1].
Valeurs de référence
Pour l’essai Xpert MTB/RIF, lorsque le complexe Mycobacterium tuberculosis est détecté, le résultat de résistance à la rifampicine est rendu comme « détectée », « non détectée » ou « indéterminée » ; un résultat « invalide » conduit à répéter le test [s1].
Facteurs qui faussent le résultat
Pour l’essai Xpert MTB/RIF, le prélèvement décrit par le CDC est une expectoration ; elle est mélangée au réactif fourni, puis placée dans une cartouche à usage unique, avec traitement automatisé dans le système GeneXpert [s1].
Dans l’étude multicentrique de Boehme et al., Xpert MTB/RIF a été évalué directement sur des expectorations non traitées et a fourni un résultat en moins de 2 heures ; ces modalités décrivent cet essai et cette étude [s4].
Le guide CDC du service MDDR décrit l’examen de la région de résistance à la rifampicine de rpoB, ainsi qu’une comparaison des résultats moléculaires avec une sensibilité fondée sur la croissance ; ces éléments relèvent de ce service et ne sont pas attribués à toutes les méthodes moléculaires [s3].
Dans l’étude multicentrique de Dorman et al., Xpert Ultra et Xpert ont eu des performances similaires pour la détection de la résistance à la rifampicine, tandis que leurs performances de détection de la tuberculose différaient [s5].
Sources
- Centers for Disease Control and Prevention (CDC). Xpert MTB/RIF Assay (2024)
- World Health Organization. WHO operational handbook on tuberculosis: module 3: diagnosis: rapid diagnostics for tuberculosis detection, 3rd ed (2024)
- Centers for Disease Control and Prevention (CDC). Molecular Detection of Drug Resistance (MDDR) in Mycobacterium tuberculosis Complex (MTBC): User Guide (2024)
- Boehme CC et al.. Rapid Molecular Detection of Tuberculosis and Rifampin Resistance (2010)
- Dorman SE et al.. Xpert MTB/RIF Ultra for detection of Mycobacterium tuberculosis and rifampicin resistance: a prospective multicentre diagnostic accuracy study (2018)